及时有效地对病原体进行识别、监测和研判分析是传染性疾病防治中的重要环节。

基因组测序是研究疾病流行的重要工具，通过对不同病原体进行全基因组测序，获得的测序数据使用相关分析软件分析，揭示各类病原微生物在基因组层面变化，有利于对各种感染性疾病病原体进行溯源和监测分析，有利于对突发疫情进行科学研判、精准防控。

为了提升检验人员对病原微生物分子的检测分析能力，忻州市疾控中心迅速完成了设备采购、场所准备、设备调试、人员培训工作，引进全新国产二代测序系统，并成功开展新冠病毒全基因组测序工作。

中心疾病检验科工作人员在工程师指导下，顺利完成了核酸提取、新冠全基因组扩增捕获、文库构建、基因测序仪运算分析和序列分析比对等工作流程，首次完成新冠病毒感染病例全基因组测序工作。本次成功测序，标志着市疾控中心检验检测技术迈上了新台阶。

第二代测序（NGS）又称为高通量测序，是基于聚合酶链反应（PCR）和基因芯片发展而来的DNA测序技术。

忻州市疾控中心引进的二代测序系统是采用自动化样本制备系统提取临床疑似感染标本中全部核酸并构建测序文库，在测序平台上进行测序获得序列信息，通过本地基因数据分析一体机进行比对与智能化算法分析，一站式轻松在本地实现从样本到分析报告的全流程。此系统能够快速、精准地实现病原识别、分型与溯源，适用于细菌、病毒等病原体。DNBSEQ-G99的SE50读长仅需3小时完成，其测序数据能够完全满足我市病原体的识别需求，采用PE100读长只需9小时即可实现病原体的精准溯源。

忻州市疾控中心首次应用二代基因测序技术完成了新冠病毒全基因组测序工作，标志着我市已具备病原微生物全基因组测序和快速分型能力。中心将持续夯实前沿技术基础，为今后重大传染病防控和突发公共卫生事件的处置及流调溯源工作提供重要的技术支撑，更好地保障全市人民身体健康。

来源：忻州市疾控中心